MAKALAH

DASAR-DASAR BIOTEKNOLOGI

PEMANFAAT ACTINOMYCETES DALAM BIDANG

BIOTEKNOLOGI PERTANIAN

DISUSUN OLEH :

1. Tati Nasriyati (24020113120051)

2. Lutfiyatul Khusni (24020113120052)

3. Ikhsanti Maliya (24020113120053)

4. Faza Laili Husna (24020113120054)

5. Miya Kurnia (24020113120055)

6. Anis Junair (24020113130117)

JURUSAN BIOLOGI

FAKULTAS SAINS DAN MATEMATIKA

UNIVERSITAS DIPONEGORO

SEMARANG

2015

BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Bahan kompos secara tradisional telah diterapkan pada tanah pertanian dan hortikultura sebagai sarana untuk memperbaiki kesuburan tanah dan pertumbuhan tanaman, terutama dengan meningkatkan sifat fisik dan sifat kimia tanah. Perubahan bahan organik juga berkontribusi untuk meningkatkan karakteristik biologi tanah, sering memberikan kontrol yang efektif dari penyakit tanah (Vargas-García dan Suárez-Estrella, 2008).

Kemampuan kompos untuk menekan patogen tanah dan tanaman, telah menjadi suatu hal yang menarik sebagai strategi untuk mengurangi efek samping dari aplikasi fungisida terhadap lingkungan. Beberapa mekanisme telah diusulkan untuk menjelaskan pengendalian penyakit tanaman dengan kompos seperti kompetisi, hyperparasitism, aktivasi gen penyakit-resisten, atau produksi antibiotik oleh mikroorganisme yang menguntungkan (Hoitink dan Boehm, 1999; Maher dkk, 2008).

Bahkan, sekitar 60% dari antibiotik yang dikembangkan untuk pertanian dan hortikultura telah diisolasi dari Streptomyces spp. (Hwang et al., 2001). Lechevalieria (sebelumnya diklasifikasikan sebagai Saccharothrix), seperti Streptomyces, adalah anggota aerobik Grampositive dari urutan Actinomycetales dalam classis Actinobacteria (Labeda et al., 2001). Sampai saat ini, hanya satu spesies Lechevalieria yang telah digambarkan sebagai produser antibiotik(Onaka, 2009). Selain itu, tidak ada aktivitas kitinolitik yang telah dilaporkan untuk genus ini.

1.2 Tujuan Penelitian

1. Untuk mengisolasi actinomycetes dari tanah, kompos 2 fase limbah pabrik zaitun dan tanah kompos diubah untuk melakukan uji in vitro antagonisme

2. Untuk mengidentifikasi strain actinomycete dengan penghambatan aktivitas tertinggi

1.3 Rumusan Masalah

1. Bagaimana cara mengisolasi actinomycetes dari tanah, kompos 2 fase limbah pabrik zaitun dan tanah kompos diubah untuk melakukan uji in vitro antagonisme

2. Bagaimana cara mengidentifikasi strain actinomycete dengan penghambatan aktivitas tertinggi

1.4 Manfaat

1. Mampu memahami cara mengisolasi actinomycetes dari tanah, kompos 2 fase limbah pabrik zaitun dan tanah kompos diubah untuk melakukan uji in vitro antagonisme dengan benar

2. Dapat mengidentifikasi strain actinomycete dengan penghambatan aktivitas tertinggi

BAB II

PEMBAHASAN

2.1. Actinomycetes

Klasifikasi Actinomycetes sp. Menurut Prihatini, dkk (2002)

Divisi : Schyzophyta

Kelas : Schizomycetes

Ordo : Actinomycetales

Famili : Actinomycetaceae

Genus : Actinomycetes

Spesies : Actinomycetes sp.

Morfologi Actinomycetes menurut Hadi, (2012) Actinomycetes merupakan bakteri dan mikroba uniselluler yang membentuk miselium sangat halus dan bercabang-cabang. Actinomycetes adalah suatu kelompok mikroorganisme yang morfologinya merupakan bentuk peralihan antara bakteri dan jamur. Actinomycetes merupakan mikroorganisme tanah yang umum dijumpai pada berbagai jenis tanah. Populasinya berada pada urutan kedua setelah bakteri, bahkan kadang-kadang hampir sama. Actinomycetes hidup sebagai saprofit dan aktif mendekomposisi bahan organik, sehingga dapat meningkatkan kesuburan tanah.

Tubuh Actinomycetes sebagai filamen sel yang bercabang panjang atau pendek. Organisme ini membelah dengan pembelahan biner, dan mungkin menghasilkan spora eksternal atau tidak. Organisme ini adalah saprofit tanah dan air ( organisme yang hidup dari benda organik yang membusuk dan sangat penting kerena perannya dalam daur alam, seperti pembusukan bahan organik dan penambatan nitrogen ). Bangsa Actinomycetes terdiri dari tiga suku yaitu Mycobacteriaceae, suku Actinomycetaceae, dan suku Streptomycetaceae (Hadi, 2012).

Actinomycetes memiliki habitat yang cukup luas antara lain ditemukan pada tanah, kompos, padang rumput, tanah hutan, sedimen, lumpur, dan pada daerah perakaran tanaman atau diperairan laut. Actinomycetes merupakan mikroorganisme tanah yang mayoritasnya adalah saprofit tanah dan air. Jumlah Actinomycetes meningkat dengan adanya bahan organik yang mengalami dekomposisi. Pada umumnya Actinomycetes tidak toleran terhadap asam dan jumlahnya menurun pada keadaan lingkungan dengan pH dibawah 5,0. Rentang pH yang paling cocok untuk pertumbuhan Actinomycetes adalah antara 6,5-8,0. Tanah yang tergenang air tidak cocok untuk pertumbuhan Actinomycetes, sedangkan gurun yang kering atau setengah kering dapat mempertahankan populasi dalam jumlah yang cukup besar, karena adanya spora. Temperatur yang cocok untuk pertumbuhan Actinomycetes adalah 25 °C -30 °C, tetapi pada suhu 55 °C -65 °C Actinomycetes masih dapat tumbuh dalam jumlah yang cukup besar khususnya genus Thermoactinomyces dan Streptomyces(Hadi, 2012).

Kebanyakan Actinomycetes bereproduksi dengan cara segmentasi dan fragmentasi. Pembentukan spora secara fragmentasi adalah pembentukan spora analog dengan protoplasma pada dinding sel pecah menjadi fragmen-fragmen yang ukurannya seragam. Fragmen-fragmen ini kemudian dibebaskan. Pembentukan spora ini dimulai dari ujung hife yang berkembang kearah pangkal. Pembentukan spora secara segmentasi adalah hife yang akan membentuk spora membentuk dinding pemisah, kemudian hife terpisah menjadi segmen-segmen kecil, dengan demikian terbentuk oidia. Beberapa spesies dapat membentuk klamidospora (Hadi, 2012).

Sifat dan Ciri Actinomycetes menurut Sembiring, (2005) yaitu:

1. Actinomycetes kelihatan dari luar seperti jamur dan dalam banyak buku dibicarakan sama dengan fungi eukariot

2. Actinomycetes dapat bersifat anaerob fakulatif yaitu mampu tumbuh baik jika terdapat oksigen bebas sehingga dapat hidup dilingkungan akuatik dan air

3. Actinomycetes tumbuh seperti filamen-filamen yang tipis seperti kapang dari pada sel tunggal sehingga Actinomycetes dianggap sebagai fungi atau cendawan. Meskipun ada persamaan dalam hal pola pertumbuhannya, yang membedakan adalah fungi itu eukariotik sedangkan Actinomycetes adalah prokariot.

4. Actinomycetes adalah bakteri gram positif aerobik yang membentuk filamen bercabang atau hifa yang panjangnya 0,5-1,0 mili mikron dan spora aseksual tumbuh sebagai filamen sel yang bercabang panjang atau pendek.

2.2. Tanah Kompos

Kemampuan kompos untuk menekan patogen tanah dan tanaman, telah menjadi suatu hal yang menarik sebagai strategi untuk mengurangi efek samping dari aplikasi fungisida terhadap lingkungan. Beberapa mekanisme telah diusulkan untuk menjelaskan pengendalian penyakit tanaman dengan kompos seperti kompetisi, hyperparasitism, aktivasi gen penyakit – resisten, atau produksi antibiotik oleh mikroorganisme yang menguntungkan (Custae, 2010).

Dalam konteks ini, actinomycetes banyak digunakan sebagai agen biokontrol, terutama spesies Streptomyces. Streptomyces adalah anggota aerobik Gram-positif dari Actinomycetales dalam classis Actinobacteria yang menghasilkan substrat bercabang luas dan miselium aerial. Sejak penemuan antibiotik pertama pada tahun 1942, telah ada upaya terus menuju skrining senyawa dari genus Streptomyces yang dikenal sebagai genus yang memproduksi antibiotik terbesar. Bahkan, sekitar 60% dari antibiotik yang dikembangkan untuk pertanian dan hortikultura telah diisolasi dari Streptomyces spp. Lechevalieria (sebelumnya diklasifikasikan sebagai Saccharothrix), seperti Streptomyces, adalah anggota aerobik Grampositive dari urutan Actinomycetales dalam classis Actinobacteria. Sampai saat ini, hanya satu spesies Lechevalieria yang telah digambarkan sebagai produser antibiotik. Selain itu, tidak ada aktivitas kitinolitik yang telah dilaporkan untuk genus ini (Custae, 2010).

Pencarian strategi biokontrol baru untuk menghambat pertumbuhan mikroorganisme fitopatogenik yang telah meluas dan menjadi penyebab masalah lingkungan. Di antara actinomycetes, spesies Streptomyces telah dipelajari secara ekstensif dan merupakan sumber penting dari antibiotik. Strain actinomycetes diisolasi dari tanah berkapur, kompos dua fase limbah pabrik zaitun ('alperujo'), dan tanah kompos diubah dengan menggunakan media selektif, dan kemudian dikultur dengan 5 jamur fitopatogenik dan 1 bakteri untuk melakukan in vitro antagonisme assay. Empat puluh sembilan strain actinomycete diisolasi, 12 strain menunjukkan aktivitas antagonis yang besar terhadap mikroorganisme fitopatogenik. Strain terisolasi diidentifikasi dengan analisis urutan 16S rDNA dan prosedur fenotipik. Sebelas isolat genus Streptomyces dan 1 actinomycetes dengan aktivitas kitinolitik genus Lechevalieria (Custae, 2010).

2.3. Isolasi Strain Actinomycetes

Sampel pertama-tama dihomogenkan dalam air pepton buffered pada 100 rpm selama 30 menit, berturutan diencerkan, dan dikultur di starch casein agar (SCA), arginine glycerol salts agar (AGSA), dan glycerol asparagine agar (International Streptomyces Medium No. 5 [ISP-5]) (Shirling dan Gottlieb, 1966), semua dilengkapi dengan cycloheximide (50 mg L^-1) untuk mengurangi kontaminasi jamur (Labeda dan Shearer, 1990). Piring pengenceran sampel diinkubasi pada 28⁰C 14e selama 21 hari sampai berspora atau koloni actinomycete non-berspora diamati. Koloni yang dipilih kemudian diinokulasi ke ragi extract malt extract agar (ISP-2) untuk pemurnian dan disimpan pada 4⁰ C agar di miringkan dan di 20% gliserol di -80⁰ C.

2.4. Actinomycetes sebagai Agen Biokontrol

Actinomycetes diisolasi dari tanah berkapur terletak di Lliria (Valencia, Spanyol) 394500400 di lintang dan 04101000 di bujur, 2 kompos dibuat dari dua fase limbah pabrik zaitun (85% berat kering) dicampur dengan pupuk kandang kuda segar (15% berat kering) dicampur dalam satu irigasi dengan air, lemak hewan, limbah protein dan lumpur selama 38 hari kompos pertama, dan tanah diubah dengan masing – masing kompos di dua tingkat (12 Mg ha 1 dan 24 mg ha 1).

Untuk menilai potensi efek penekan actinomycete, 5 fitopa- jamur Fusarium oxysporum f e. sp. melonis (CECT 20.474), Phytophthora cinnamomi (CECT 20186), Pythium debaryanum (CECT 2362), Sclerotinia sclerotiorum (CECT 2823), dan Thanatephorus cucumeris (CECT 2813) e dan 1 bakteri e Agrobacterium tumefaciens (CECT 4119) e diperoleh dari "colección Española de Cultivos Tipo "(CECT) yang termasuk dalam in vitro antagonisme percobaan. Percobaan sebelumnya menggunakan enam media kultur yang berbeda menunjukkan bahwa kegiatan antijamur maksimum actinomycetes diperoleh dengan agar-agar potato dextrose agar (PDA) dan yeast-malt extract agar (YMA) (data tidak ditampilkan). Kemudian, strain jamur diinkubasi pada 28⁰C pada PDA dan YMA media 5 sampai 7 hari. A. tumefaciens strain dikultur pada agar nutrien (NA) pada suhu yang sama selama 24 jam.

Dengan tujuan memperoleh mikroorganisme tumbuh aktif, strain actinomycete diinkubasi pada PDA (Castillo et al, 2002;.. Getha et al, 2005) dan YMA (Gomes et al, 2000.) pada suhu 28⁰C selama 7 hari atau sampai sporulasi terbentuk. Dari media ini, 4 agar busi dari 6 mm diameter (sesuai dengan 4 strain terisolasi yang berbeda) dipindahkan di posisi berjarak sama ke cawan Petri yang berisi YMA dan PDA, dan diinkubasi selama 7 hari pada 28⁰ C. Setelah periode ini, plug dengan miselia jamur ditempatkan di tengah piring dan co-kultur di 28⁰ C selama 7 sampai 14 hari. Antagonisme ditentukan dengan mengukur jarak antara tepi pertumbuhan actinomycetes dan jamur, maka membangun 4 tingkat inhibisi: maksimum (þþþ), mencetak sebagai penghambatan jarak> 2 cm, menengah (þþ) sebagai jarak 2 sampai 1 cm, minimum ( þ) sebagai pengukuran <1 cm, dan tidak ada antagonisme (e) ketika kontak antara actinomycetes dan jamur terjadi. Dua ulangan dilakukan untuk masing-masing strain antagonis dugaan dan jamur fitopatogenik.

Dari uji in vitro, 12 strain actinomycete yang ditemukan sangat efektif dalam penindasan sebagian besar 5 referensi jamur fitopatogenik diuji, sehingga memberikan 24,5% isolat dengan efek penghambatan yang kuat (Tabel 1). Persentase ini mirip dengan yang dilaporkan oleh penulis lain (Larkin dan Fravel, 1998). Sungguh luar biasa bahwa 7 strain (CO2-16, S-1, S-2, S-3, S-5, S-6, dan T8-2) menunjukkan aktivitas antijamur yang tinggi terhadap strain patogen 5, sedangkan aktivitas antagonis terhadap strain jamur 2E4 diamati di 5 sisa isolat actinomycete (CO2-9, S-7, T2- 10, T2-19, dan T6-32).

Sebelum tes, A. tumefaciens ditumbuhkan pada NA (lihat Bagian 2.3) dan ditangguhkan dalam kaldu nutrisi steril (NB) dengan konsentrasi disesuaikan dengan sekitar 1,5 - 108 CFU mL^-1. Inokulum bakteri ini adalah homogen dan berurut diencerkan dengan 1,5- 107, 1,5- 106 dan 1,5-105 CFU mL^-1, masing-masing. Salah satu mililiter suspensi dihasilkan ditambahkan ke dalam tabung reaksi yang berisi 19 mL cairan steril NA di ca. 50⁰C, vortexed, dan dipindahkan ke cawan Petri. Setelah dipadatkan, 6 busi (6 mm diameter) dari actinomycetes tumbuh di YMA dan PDA yang equidistantly diposisikan pada setiap media diinokulasi dan diinkubasi pada 28⁰ C. Setelah 24 dan 48 jam inkubasi, zona inhibisi diukur sebagai jarak radial antara pertumbuhan bakteri dan actinomycete.

Uji dengan A. tumefaciens mengungkapkan bahwa 3 actinomycete strain e S-6, T2-10, dan T8-2 e memiliki aktivitas antimikroba terhadap spesies fitopa- ini. Zona penghambatan radial dikendalikan setelah 48 jam inkubasi yang lebih luas daripada yang tercatat setelah inkubasi selama 24 jam, sehingga menunjukkan bahwa actinomycetes masih memproduksi senyawa antibiotik. Jarak antara actinomycetes dan pertumbuhan bakteri setelah 48 jam disajikan pada Tabel 2.

2.5. Identifikasi Strain Actinomycete Antagonis

Strain actinomycete yang menunjukkan efek penghambatan tertinggi terhadap mikroorganisme fitopa- diuji dipilih untuk dilakukan identifikasi dengan menggunakan prosedur molekuler dan fenotipik.

DNA genomik total diekstraksi sesuai dengan CTAB (setiltrimetilamonium bromida, Sigma) prosedur (Wilson, 1987) dan kemudian mengalami PCR (polymerase chain reaction) amplifikasi menggunakan primer 27F dan 1525r seperti yang dijelaskan oleh Lane (1991). Setiap 50 mL PCR berisi 1 mL ekstrak DNA, 1,5 mM MgCl2, 0,2 mM masing-masing dNTP (Ecogen), 0,4 mM masing-masing primer, dan 1,5 polimerase Taq DNA U (Ecogen) dengan 1x PCR penyangga. Amplifikasi Apakah dilakukan dalam PTC-100 Peltier Cycler Thermal menggunakan program: Denaturasi awal pada 95⁰C selama 5 menit dan 30 siklus pada 95⁰C selama 1 menit; annealing pada 54 C selama 1 menit; dan, ekstensi primer pada 72⁰ C selama 1 menit diikuti dengan ekstensi akhir pada 72⁰ C selama 10 menit. Kontrol e mana template DNA digantikan oleh air steril juga termasuk dalam setiap percobaan PCR. Produk PCR dimurnikan dengan GenElute PCR Clean-up Kit (Sigma) dengan set yang sama primer. Urutan gen 16S rDNA diperoleh menggunakan ABI PRISM *BigDye* Terminator Cycle Sequencing Kit (versi 3.1) dan sequencer otomatis Applied Biosystems 3730xl DNA.

Analyzer. Urutan gen 16S rDNA secara manual dirakit dari kombinasi fragmen terpisah dihasilkan dengan forward dan reverse primer sequencing menggunakan program PHYDIT (Chun, 1995). Urutan yang dugaan diidentifikasi menggunakan program (Basic Local Keselarasan Tool) BLAST (NCBI; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Urutan hampir lengkap yang selaras terhadap urutan referensi strain. Pohon filogenetik yang disimpulkan menggunakan algoritma tetangga-bergabung (Saitou dan Nei, 1987) dari program program PHYLIP suite (Felsenstein, 1993), dan matriks jarak evolusi disiapkan setelah Jukes dan Cantor (1969). Topologi pohon unrooted dihasilkan dievaluasi dalam analisis bootstrap (Felsenstein, 1985) berdasarkan 1000 resamplings dari dataset tetangga-bergabung menggunakan paket program PHYLIP.

Isomer asam Diaminopimelic dari ekstrak seluruh sel ditentukan pada ISP-2 strain actinomycete dibiakkan (5 hari di 28derajat C) sesuai dengan prosedur standar (Staneck dan Roberts, 1974). Produksi udara spora-massa warna, substrat pigmentasi miselium, pigmen dapat didifusi, dan melanin direkam pada Media Kutur Streptomyces Proyek Internasional (Shirling dan Gottlieb, 1966) setelah 14 hari inkubasi pada 28? C. Spora-rantai morfologi dari kultur diinkubasi selama 10-14 hari pada ISP-5 yang diamati dengan mikroskop cahaya.

Kitinase ditentukan oleh melesat strain actinomycete pada media kultur seperti yang dijelaskan oleh Kawase dkk. (2004). Produksi kitinase telah dinilai dengan pemeriksaan visual dari zona dibersihkan dikembangkan di sekitar koloni diinkubasi selama 7 dan 14 hari.

Setelah mempelajari morfologi dan pigmentasi sifat koloni, semua isolat e kecuali strain T2-19 e yang dugaan ditugaskan untuk genus Streptomyces (Tabel 3). Seperti yang ditunjukkan pada Gambar. 1, identifikasi dicapai dari urutan gen 16S rDNA mengungkapkan bahwa 11 actinomycete isolat milik genus Streptomyces dengan 8 spesies yang berbeda yang diwakili: 3 strain diidentifikasi sebagai Streptomyces variegatus (S-1, S-2, dan S-3; Gambar. 1d), 2 sebagai Streptomyces griseoruber (S-5 dan T6-32;. Gambar 1f), 1 sebagai Streptomyces lincolnensis (CO2-9; Fig.1f), 1 sebagai Streptomyces lusitanus (S-6; 1c Gambar), 1. sebagai Streptomyces aureoverticillatus (CO2-16;. Gambar 1e), 1 sebagai olivochromogenes Streptomyces (S-7;. Gambar 1b), 1 sebagai Streptomyces coeruleorubidus (T2-10;. 1a Gambar), dan 1 sebagai Streptomyces albogriseolus (T8-2 ; Gambar 1f).. Nukleotida kesamaan antara Streptomyces terisolasi dan strain referensi yang sesuai (Gambar. 1) berkisar antara 99,43% untuk S-1 sampai 100% untuk T2-10 dan T8-2. Hasil ini mendukung bahwa streptomycetes telah diteliti terutama sebagai agen biokontrol, karena mereka sering dan mudah diisolasi, dan produksi antibiotik mereka membangkitkan bunga komersial yang signifikan (Anderson dan Wellington, 2001).

Strain T2-19 (nomor aksesi FN808347) adalah satu-satunya isolat nonstreptomycete milik genus Lechevalieria. Posisi filogenetik strain T2-19 (Gbr. 2) adalah antara Lechevalieria xinjiangensis (Wang et al., 2007) dan cluster terdiri dari Lechevalieria atacamensis, Lechevalieria roselyniae, dan Lechevalieria deserti (Okoro et al., 2010). Urutan kesamaan antara regangan T2-19 dan L.

Strain T2-19 (nomor akses FN808347) merupakan satu-satunya isolate non Streptomyces berdasarkan genus Lechevalieria. Posisi filogeni strain T2-19 berada diantara Lechevalieria xinjiangensis dan kelompok terbentuk dari Lechevalieria atacamnensis, Lechevalieria roselyniae, dan Lechevalieria deserti. Persamaan sekuen strain T2-19 dengan Lechevalieria xinjiangensis , L. roselyniae, dan L. deserti adalah 99,19%, 99,41%, dan 99,09% secara respektif. Bagaimanapun referensi yang paling memugkinkan yaitu strain L. atacamensis (99,41%) DNA:DNA hybridisasi dan taksonomi polifasik yang akurat seperti halnya deskripsi fenotip akan diungkapkan di keperluan mendatang untuk memperjelas posisi taksonomi strain T2-19.

Pendalaman tentang penelitian karakter fenotip, isolate actinomyces adalah gram +, aerobic, dan tanpa fragmen miselium. Strain streptomyces menghasilkan hifa aerial dalam jumlah yang tidak banyak, dimana isolate T2-19 menunjukkan perkembangan miselium aerial yang kecil. Pada penambahan, lapisan peptidoglikan pada streptomyces mengandung asam L-diaminopimelic (dinding sel tipe I), dimana asam meso-diaminopimelic (dinding sel tipe III) dideteksi pada Lechevalieria T2-19. Pigmen yang berdifusi dihasilkan oleh strain CO2-9, S-5, T2-10, dan T8-2: produksi melanin dideteksi oleh pigmentasi coklat dari kultur medium ISP-6 pada 8 strain (CO2-9, CO2-16, S-1,S-2,S-3,S-5, T2-10, dan T8-2). Berdasarkan morfologi rantai spora yang diamati di bawah mikroskop cahaya, CO2-9,CO2-6,S-1,S-2,S-3, dan S-6 dikelompokkan sebagai rectus flexibilis (RF), dan S-5,S-7,T2-10,T6-32, dan T8-2 sebagai spira (s),dimana strain T2-19 tidak menghasilkan miselium aerial. Pendalaman tentang aktivitas kitinolitik, strain T2-19 merupakan satu-satunya yang memiliki kemampuan mendegradasi colloidal kitin. Bagaimanapun, sintesis kitinase yang terlihat tidak menjadi mekanisme utama inhibitor fungi dari Lechevalieria T2-19 sejak menghambat secara penuh oomycetes P. annamomi dan P. debarynum yang tidak memiliki kitin pada dinding selnya. Aktifitas anti fungal ditunjukkan oleh streptomyes dan isolat Lechevalieria pada penelitian ini berhubugan dengan sintesis komponen antibiotic.

BAB III

PENUTUP

3.1. Simpulan

1. Sampel dari tanah kompos dikulturkan di medium SCA, AGSA, dan glyserol asparagine agar diinkubasi selama 21 hari pada suhu 28^oC. Koloni jamur yang terbentuk diinokulasi pada malt ekstrak agar miring dan disimpan pada suhu 4^oC.

2. Isolat actinomycet memiliki kemampuan hambat paling tinggi terhadap 6 strain jamur fitophatogenik yaitu isolat S-6, T2-10, dan T8-2 yang berasal dari genus Streptomyces.

3.2. Saran

Diperlukan penelitian lebih lanjut untuk aplikasi strain actinomycet sebagai agen biokontrol yang efektif dan spesifik.

DAFTAR PUSTAKA

Hadi, mochammad. 2012. Konservasi Sumber Daya Alam dan Pengelolaan Lingkungan. Laboratorium Ekologi Dan Biosistematik Jurusan Biologi Fmipa UNDIP

Prihatini, dkk. 2002. Pemanfaatan Mikroba dalam Tanah. Jakarta: Medan press

Sembiring, dkk. 2005. Peranan Biofertilizer dalam Pertanian Organik. Medan: Universitas Sumatera Utara press.

Cuesta, Gonzalo et.al. 2010. Isolation and identification of actinomycetes from a compost-amended soil with potential as biocontrol agents. Journal of Environmental Management 95 (2012) S280eS284

Junairanis

Cari Blog Ini

Makalah Dasar-Dasar Bioteknologi: Pemanfaatan Actinomycetes dalam Bidang Pertanian